01읽고, 돌리고, 고쳐보기

출발점이 되는 모델들

한 번에 다 읽을 수 있을 만큼 작은 완성된 프로그램입니다. 하나를 골라 상수를 바꾸고, 무엇이 움직이는지 보세요.

02프로그램

간단한 효소 반응

미하엘리스-멘텐을 두 가지 방식으로 — 두 단계의 기본 반응, 그리고 그것을 요약한 하나의 protein 추상.

SimpleEnzymeReaction.lpp

// =============================================
//  Simple Enzyme Reaction Model
//  E + S <-> ES -> E + P  (Michaelis-Menten)
// =============================================

// binding, reversible, mass-action
reaction R_bind(E + S -> ES, k = 30, kr = 1)

// catalysis, irreversible
reaction R_cat(ES -> E + P, k = 10)

// initial concentrations
E = 1.0, S = 5.0

// --- the same kinetics as one abstraction ---
protein enz(sub -> prod, k = 10, km = 0.3666667)
enz = 1.0, sub = 5.0

03더 보기

나머지는 준비 중입니다

신호전달 캐스케이드, 경쟁적 저해, 투약 모델을 정리하고 있습니다. 그전까지는 소스 저장소에 동작하는 예제들이 있습니다.