01문법과 의미
언어를, 정확하게
각 구문이 무엇을 뜻하고, 무엇으로 컴파일되며, 무엇을 전제하는지. 둘러보기가 아니라 레퍼런스입니다.
02한눈에
가장 많이 쓰게 될 두 가지 형태
reaction NAME(A + B -> C, k = <forward>, kr = <reverse>)
protein NAME(sub -> prod, k = <kcat>, km = <michaelis>)
A = <concentration>, B = <concentration>03레퍼런스
01
화학종과 농도
존재하는 것들을 선언하고, 시작 값을 주는 방법.
02
reaction
기본 단계: 반응물과 생성물, 정·역방향 상수, 그리고 여기서 질량작용이 뜻하는 것.
03
protein
효소 추상 — 결합과 촉매 한 쌍을 하나의 선언으로, k와 km으로 매개변수화합니다.
04
환경
모델이 돌아가는 조건과, 시뮬레이터가 그것을 다루는 방식.
05
출력
실행이 무엇을, 어떤 해상도로 내놓는지, 그리고 그것을 담는 방법.
06
모듈
모델을 여러 파일로 나누고, 한 모델의 일부를 다음 모델에서 다시 쓰는 방법.